清算土地增值稅時需要注意以下事項：
1. 確認納稅義務人：清算土地增值稅的納稅義務人應該是土地出讓方。如果土地出讓方是企業，應該由企業進行納稅；如果土地出讓方是個人，則應該由個人進行納稅。
2. 計算應納稅額：土地增值稅的應納稅額應該是土地出讓價款與土地取得成本之差。其中，土地取得成本包括土地使用權取得費用、土地整理費用、規劃設計費用、建設用地補償費用等。
3. 確認稅率：土地增值稅的稅率為30%。但是，對于個人出售住房的土地增值稅，稅率可以根據房屋持有年限的長短進行遞減。
4. 繳納稅款：清算土地增值稅后，納稅義務人需要按照規定的稅率和應納稅額繳納稅款。稅款應在土地出讓款到賬后的15個工作日內繳納。
5. 辦理稅務登記：納稅義務人需要在稅務機關辦理稅務登記，并在規定時間內申報土地增值稅納稅申報表。
6. 納稅申報：納稅義務人需要在規定時間內向稅務機關申報土地增值稅納稅申報表，并繳納相應的稅款。
7. 監督檢查：稅務機關會對納稅義務人進行監督檢查，確保其納稅行為合法合規。如果發現納稅義務人存在違法行為，稅務機關將依法進行處理。