問：跨地區經營的分支機構營業賬簿如何申報繳納印花稅？

答：根據《國家稅務總局關于印花稅若干具體問題的規定》（（1988）國稅地字第25號）規定：“跨地區經營的分支機構使用的營業賬簿，應由各分支機構在其所在地繳納印花稅。對上級單位核撥資金的分支機構，其記載資金的賬簿按核撥的賬面資金數額計稅征收印花稅；對上級單位不核撥資金的分支機構，營業賬簿不征收印花稅。為避免對同一資金重復計征，上級單位記載資金的賬簿，應按扣除撥給下屬機構資金數額后的其余部分計征印花稅。”

問：所有的二級分支機構都需要就地分攤企業所得稅嗎？

答：根據《國家稅務總局關于印發〈跨地區經營匯總納稅企業所得稅征收管理辦法〉的公告》（國家稅務總局公告2012年第57號）第五條規定：“以下二級分支機構不就地分攤繳納企業所得稅：

（一）不具有主體生產經營職能，且在當地不繳納增值稅、營業稅的產品售后服務、內部研發、倉儲等匯總納稅企業內部輔助性的二級分支機構，不就地分攤繳納企業所得稅。

（二）上年度認定為小型微利企業的，其二級分支機構不就地分攤繳納企業所得稅。

（三）新設立的二級分支機構，設立當年不就地分攤繳納企業所得稅。

（四）當年撤銷的二級分支機構，自辦理注銷稅務登記之日所屬企業所得稅預繳期間起，不就地分攤繳納企業所得稅。

（五）匯總納稅企業在中國境外設立的不具有法人資格的二級分支機構，不就地分攤繳納企業所得稅。“

問：我公司在外地成立獨立核算的分支機構，是否應當獨立計算申報并就地繳納企業所得稅？

答：居民企業在中國境內跨地區（指跨省、自治區、直轄市和計劃單列市）設立不具有法人資格分支機構的，該居民企業為跨地區經營匯總納稅企業，除另有規定外，其企業所得稅征收管理適用國家稅務總局公告2012年第57號的規定（統一計算、分級管理、就地預繳、匯總清算、財政調庫）。因此，分支機構是否獨立核算，不影響所得稅匯總繳納。

問：分支機構是否可以獨立享受小型微利企業所得稅減免政策？

答：現行企業所得稅實行法人稅制，企業應以法人為主體，計算并繳納企業所得稅。《中華人民共和國企業所得稅法》第五十條第二款規定“居民企業在中國境內設立不具有法人資格的營業機構的，應當匯總計算并繳納企業所得稅”。由于分支機構不具有法人資格，其經營情況應并入企業總機構，由企業總機構匯總計算應納稅款，并享受相關優惠政策。

因此，企業設立不具有法人資格的分支機構，應當先匯總計算總機構及其各分支機構的從業人數、資產總額、年度應納稅所得額，再依據各指標的合計數判斷是否符合小型微利企業條件。

問：跨地區經營匯總納稅企業上一季度不符合小型微利企業條件，已由分支機構就地預繳分攤稅款，本季度按現有規定符合小型微利企業條件，上季度已就地分攤預繳的企業所得稅如何處理？

答：匯總納稅企業如果上季度不符合小型微利企業條件，本季度符合條件，其總機構和二級分支機構多預繳的稅款，根據《國家稅務總局關于落實小型微利企業所得稅優惠政策征管問題的公告》（國家稅務總局公告2023年第6號）規定，可在以后季度應預繳的企業所得稅稅款中抵減。

問：總公司設立在上海，分支機構設立在西部大開發稅收優惠地區，分支機構是否能夠單獨享受西部大開發企業所得稅優惠政策？

答：可以享受。

根據《國家稅務總局關于深入實施西部大開發戰略有關企業所得稅問題的公告》（國家稅務總局公告2012年第12號）第六條規定，總機構設在西部大開發稅收優惠地區外的企業，其在優惠地區內設立的分支機構（不含僅在優惠地區內設立的三級以下分支機構），僅就該分支機構所得確定適用15%優惠稅率。在確定該分支機構是否符合優惠條件時，僅以該分支機構的主營業務收入是否符合《西部地區鼓勵類產業目錄》及其主營業務收入占其收入總額的比重加以確定。該企業應納稅所得額的計算和所得稅繳納，按照國稅發〔2008〕 28號第十六條和國稅函〔2009〕 221號第二條的規定執行。

問：總公司設立在上海，分支機構設立在海南自由貿易港，分支機構是否能夠單獨享受海南自貿港企業所得稅優惠政策？

答：可以享受。

根據《關于海南自由貿易港企業所得稅優惠政策的通知》（財稅〔2020〕31號）、《關于海南自由貿易港企業所得稅優惠政策有關問題的公告》（國家稅務總局海南省稅務局公告2020年第4號）規定，對總機構設在海南自由貿易港以外的企業，僅就其設在海南自由貿易港的分支機構（不含在海南自由貿易港以外設立的二級以下分支機構在海南自由貿易港設立的三級以下分支機構）判斷是否符合規定條件，適用15%稅率，設在自貿港以外的總機構和分支機構不納入判斷范圍。

問：跨地區經營匯總納稅企業如何辦理匯算清繳手續？

答：根據《國家稅務總局關于印發〈跨地區經營匯總納稅企業所得稅征收管理辦法〉的公告》（國家稅務總局公告2012年第57號）第十條規定，匯總納稅企業應當自年度終了之日起5個月內，由總機構匯總計算企業年度應納所得稅額，扣除總機構和各分支機構已預繳的稅款，計算出應繳應退稅款，按照本辦法規定的稅款分攤方法計算總機構和分支機構的企業所得稅應繳應退稅款，分別由總機構和分支機構就地辦理稅款繳庫或退庫。匯總納稅企業在納稅年度內預繳企業所得稅稅款少于全年應繳企業所得稅稅款的，應在匯算清繳期內由總、分機構分別結清應繳的企業所得稅稅款；預繳稅款超過應繳稅款的，主管稅務機關應及時按有關規定分別辦理退稅。

問： 匯總納稅企業所得稅的二級分支機構準備注銷，注銷前分支機構是否要提前申報季度和年度的企業所得稅？

答：根據《國家稅務總局關于印發〈跨地區經營匯總納稅企業所得稅征收管理辦法〉的公告》（國家稅務總局公告2012年第57號）第五條第四項規定，當年撤銷的二級分支機構，自辦理注銷稅務登記之日所屬企業所得稅預繳期間起，不就地分攤繳納企業所得稅。“自辦理注銷稅務登記之日”是指稅務機關受理注銷申請之日。因此，匯總納稅的分支機構，無需提前辦理企業所得稅納稅申報。