出口企業(yè)以來料加工貿(mào)易方式免稅進口原材料、零部件后，憑海關(guān)核簽的來料加工進口貨物報關(guān)單和來料加工登記手冊向主管出口退稅的稅務(wù)機關(guān)申請辦理“來料加工貿(mào)易免稅證明”，持此證明向主管征稅的稅務(wù)機關(guān)申請辦理免征其加工或委托加工貨物及其工繳費的增值稅、消費稅。貨物出口后，出口企業(yè)應(yīng)憑來料加工出口貨物報關(guān)單和海關(guān)已核銷的來料加工登記手冊、收匯憑證向主管出口退稅的稅務(wù)機關(guān)辦理核銷手續(xù)。逾期未核銷的，主管出口退稅的稅務(wù)機關(guān)會同海關(guān)和主管征稅的稅務(wù)機關(guān)予以補稅和處罰（國稅發(fā)［1994］031號）。

　　主管出口退稅的稅務(wù)機關(guān)在出具“來料加工貿(mào)易免稅證明”之前，應(yīng)按出口退稅電子化管理辦法的要求，對出口企業(yè)填報的“來料加工貿(mào)易免稅證明”的有關(guān)信息進行電子信息化對審，審核無誤后方能簽署有關(guān)印章（國稅發(fā)［1996］79號）。