在建工程是指企業正在建設中的工程項目，包括土地平整、基礎設施建設、建筑施工、裝修裝飾等。在建工程的二級科目包括：
1. 建筑工程：包括房屋建筑、橋梁、隧道、道路、水利工程等建筑工程項目。
2. 機電工程：包括電氣、通信、給排水、暖通空調等機電工程項目。
3. 安裝工程：包括電梯、消防、智能化、環保等安裝工程項目。
4. 裝修裝飾工程：包括室內、外墻、景觀、廣告等裝修裝飾工程項目。
5. 其他工程：包括土地平整、園林綠化、臨時設施、拆遷補償等其他工程項目。

以上是在建工程的常見二級科目，具體的科目設置還需要根據企業自身情況進行調整。