土地增值稅扣除的注意事項如下：
1. 所得稅法規定，納稅人取得土地增值收益的，應當繳納土地增值稅。納稅人在計算所得稅時，可以扣除已經繳納的土地增值稅。
2. 土地增值稅扣除的范圍包括土地增值稅的實際繳納額和已經扣除的土地增值稅。
3. 扣除土地增值稅時，應當按照實際繳納的土地增值稅額進行扣除，不得超過實際繳納的土地增值稅額。
4. 如果納稅人在取得土地增值收益時沒有繳納土地增值稅，那么在計算所得稅時就不能扣除土地增值稅。
5. 土地增值稅扣除應當在所得稅申報時進行，如果已經申報并繳納所得稅，但沒有扣除土地增值稅，可以在納稅期限內進行補扣。
6. 在扣除土地增值稅時，應當注意區分土地增值稅和其他稅費的性質和范圍，不要混淆或重復扣除。
7. 納稅人應當保留土地增值稅的相關憑證和證明文件，以備稅務機關查驗。