確認員工預支工資的金額需要按照以下步驟進行：
1. 首先，需要核對員工預支工資的申請單和相關的支持文件，如工資單、銀行轉賬記錄等，確保這些文件的真實性和準確性。
2. 然后，需要確認員工預支工資的金額是否符合公司規定和政策，例如公司是否規定有最高預支額度等。
3. 接下來，需要確認員工預支工資的用途是否符合公司的業務需要和政策要求，例如是否用于公司業務活動、是否符合公司預算等。
4. 最后，需要將確認后的員工預支工資金額記錄在公司的預支工資臺賬中，并及時更新員工工資信息。

需要注意的是，在確認員工預支工資金額時，應當注意保護員工的隱私和個人信息，確保信息的保密性。