應交稅費和稅金及附加的差異通常是由以下幾種情況引起的：
1. 征收標準不同：應交稅費和稅金及附加的征收標準可能不同，導致應交稅費和稅金及附加的計算結果不同。
2. 計算方法不同：應交稅費和稅金及附加的計算方法可能不同，例如，應交稅費按照銷售額計算，而稅金及附加按照利潤計算，這樣可能會導致應交稅費和稅金及附加的差異。
3. 會計處理不當：如果會計處理不當，例如，將應交稅費和稅金及附加計入不正確的賬戶，或者計算錯誤，也可能導致應交稅費和稅金及附加的差異。
4. 稅務部門調整：稅務部門可能會對企業的應交稅費和稅金及附加進行調整，例如，對企業的稅務申報進行審核，發現存在錯誤或漏報等情況，這也可能導致應交稅費和稅金及附加的差異。

因此，企業在處理應交稅費和稅金及附加時，需要注意以上幾種情況，避免出現差異。同時，企業應該建立完善的會計制度和內部控制制度，確保應交稅費和稅金及附加的計算和處理準確無誤。