物業公司水費差額征稅是指物業公司在向業主收取水費時，將水費按照稅率計算后，將稅額加入到水費中向業主收取，然后再將稅額上繳給稅務部門的一種稅收征收方式。具體申報流程如下：
1. 首先，物業公司需要按照稅務部門的要求開具發票，將稅額單獨列出，并在發票上注明“差額征稅”。
2. 然后，物業公司需要在納稅申報表中，將差額征稅的稅額單獨列出，與其他應納稅額一起申報繳稅。
3. 物業公司還需要在繳稅時，將差額征稅的稅額單獨繳納給稅務部門。

需要注意的是，物業公司在申報差額征稅時，需要按照稅務部門的要求填寫相關申報表格，并在申報時準確計算稅額，避免漏報或誤報導致稅務風險。同時，物業公司還需要保留好相關發票和申報材料，以備稅務部門的查驗。