企業年度審計費應該計入“管理費用”科目。在企業的會計科目中，管理費用是指企業在日常經營活動中發生的、為管理和運營企業所發生的費用，包括企業管理人員的薪酬、辦公費用、差旅費用、培訓費用、審計費用等。因此，企業年度審計費應該計入管理費用科目中。