支付代理記賬費用的會計處理如下：
1. 記錄代理記賬費用支出的會計憑證，借記“代理記賬費用”科目，貸記“銀行存款”科目。
2. 在賬務處理中，將代理記賬費用歸入“管理費用”或“業務拓展費用”科目中，具體歸屬科目根據公司的會計政策和實際情況而定。
3. 在月末或年末結賬時，將代理記賬費用計入損益表中，作為公司的費用支出，減少公司的稅前利潤。

需要注意的是，在支付代理記賬費用時，應當及時核對費用金額和發票的真實性和合法性，以確保公司的財務安全和合規性。