納稅總額在工商年檢中應該填寫上一年度企業所得稅納稅申報表上的納稅總額。具體填寫方法如下：
1. 打開上一年度企業所得稅納稅申報表，找到納稅總額這一項，將該項數值填寫在工商年檢表中。
2. 如果企業所得稅納稅申報表中沒有明確列出納稅總額，可以在申報表中找到其他涉及納稅總額的項，如應納稅所得額、應納稅所得額減免等，將這些數值相加得到納稅總額，然后填寫在工商年檢表中。

需要注意的是，企業所得稅納稅申報表中的納稅總額應該是經過稅務機關審核確認的數值，如果企業在工商年檢時填寫的納稅總額與實際情況不符，可能會面臨罰款等后果。因此，在填寫工商年檢表時，應該仔細核對納稅總額的數值，確保填寫正確。