新企業會計準則科目表與舊企業會計準則科目表的主要不同在于以下幾個方面：
1. 科目數量：新企業會計準則科目表的科目數量相對較少，但更為精簡和系統化，總共只有42個科目，而舊企業會計準則科目表則有100多個科目。
2. 科目分類：新企業會計準則科目表對科目進行了更為細致的分類，包括資產、負債、所有者權益、收入、成本、費用等六大類，每一類下面又有若干個小類，更加清晰明了。舊企業會計準則科目表則沒有這么細致的分類。
3. 科目名稱：新企業會計準則科目表的科目名稱更加簡潔明了，更符合現代經濟的發展趨勢。例如，新準則將“長期待攤費用”改為“預付款項”，將“其他應付款”改為“應付款項”，將“營業外支出”改為“非經營性支出”等。
4. 會計處理：新企業會計準則科目表對某些會計處理方式進行了調整，如對于固定資產的計量方法進行了調整，取消了以往的“原值”和“凈值”計量方法，改為“成本”計量方法。

總的來說，新企業會計準則科目表更加簡潔、系統化，更符合現代經濟的發展趨勢，更加適應企業的會計處理需求。