工會經費的余額應該按照工會章程的規定進行處理，通常有以下幾種方式：
1. 轉入下一年度的經費：如果工會章程規定可以將余額轉入下一年度的經費中使用，那么可以將余額直接劃入下一年度的經費賬戶中。
2. 返還給會員：如果工會章程規定可以將余額返還給會員，那么可以按照規定將余額返還給會員。
3. 捐贈：如果工會章程規定可以將余額捐贈給慈善機構或其他組織，那么可以按照規定將余額捐贈出去。
4. 存入銀行：如果工會章程規定可以將余額存入銀行，那么可以將余額存入銀行獲得利息收益。

處理工會經費的余額，應該遵守工會章程的規定，并進行相應的會計處理，確保經費使用合規、透明、公正。