工程利潤率和毛利率都是企業經營管理中的重要指標，但它們的計算方法和涵義有所不同。

毛利率是指企業銷售商品或提供服務所獲得的毛利潤與銷售收入的比率，通常用來反映企業的經營效益和盈利能力。毛利率計算公式為：

毛利率 = （銷售收入 - 銷售成本）/ 銷售收入 × 100%

其中，銷售成本包括直接材料、直接人工和制造費用等。

而工程利潤率是指企業在承接工程項目時，所獲得的利潤與工程總成本的比率，通常用來評估企業承接工程項目的盈利能力和風險控制能力。工程利潤率計算公式為：

工程利潤率 = （工程利潤 / 工程總成本）× 100%

其中，工程總成本包括直接成本和間接成本等。

因此，毛利率和工程利潤率的計算方法和涵義不同，需要根據具體情況選擇適當的指標進行評估。