當公司支付車船稅時，應該按照以下步驟進行入賬：
1. 首先，應該確認車船稅的金額和支付方式，確保其符合公司的預算和財務計劃。
2. 然后，將車船稅的支付記錄記入公司的現金日記賬或銀行日記賬中，以記錄公司的實際支出。
3. 接下來，根據車船稅所屬的會計科目，將支出金額記入相應的費用科目中。例如，如果車船稅屬于車輛運營成本，則應該將支出金額記入車輛運營成本科目中。
4. 如果車船稅的支付方式為銀行轉賬，則需要將銀行流水記錄與現金日記賬或銀行日記賬進行核對，以確保支付記錄的準確性。

需要注意的是，保險代交車船稅的入賬方式可能因公司的具體情況而有所不同，因此在進行入賬時應該根據實際情況進行調整。同時，公司應該遵守相關的會計準則和法規，確保會計記錄的準確性和合規性。