在途物資的運費應該計入“在途物資”科目下的“運輸費用”子科目中，作為在途物資的成本。在途物資是指已經發出但還未到達目的地的物資，運輸費用是將物資從發貨地點運輸到目的地所發生的費用，這些費用應該計入在途物資的成本中。