公司購買的廠房對廠房的裝修費用應分別計入以下會計科目：
1. 廠房賬戶：購買廠房的成本應計入該科目，包括房屋本身的價值和購買時的相關費用（如中介費、印花稅等）。
2. 裝修費用賬戶：廠房裝修的費用應計入該科目，包括設計、施工、材料等費用。

需要注意的是，裝修費用應當根據實際情況進行分類。如果裝修費用與廠房的購買價值相比較小，可以將其作為廠房的修繕費用計入廠房賬戶中；如果裝修費用相對較大，可以將其單獨計入裝修費用賬戶中。同時，在計算折舊時，也應根據實際情況對廠房和裝修費用進行分別計算。