南京二手房個稅計算公式如下：

個稅=（房屋交易價格-房屋原價）×適用稅率-速算扣除數

其中，房屋交易價格是指二手房的實際成交價格；房屋原價是指購買二手房時的原價，一般是指購房合同中的價格；適用稅率根據購房年限確定，具體如下：
1. 購房滿5年及以上：適用稅率為1%
2. 購房不滿5年：適用稅率為2%

速算扣除數根據購房年限確定，具體如下：
1. 購房滿5年及以上：速算扣除數為0
2. 購房不滿5年：速算扣除數為房屋交易價格×70%

需要注意的是，南京二手房個稅計算公式中的房屋交易價格和房屋原價都是指人民幣金額，且個稅計算結果需四舍五入取整數。