在避免重復計算子女教育扣除額度的情況下，可以采取以下措施：
1. 雙方協商：雙方都填寫了子女教育扣除，可以協商決定由其中一方進行申報，另一方不再申報。這樣可以避免重復計算扣除額度。
2. 分攤扣除額度：如果雙方都希望享受子女教育扣除，可以協商決定按比例分攤扣除額度。例如，每個人分別申報一半或按照子女教育費用的實際支付比例進行分攤。
3. 提供相關證明文件：如果雙方都堅持要申報子女教育扣除，可以提供相關證明文件，如子女的學費收據、教育機構的收費證明等，以證明扣除額度的合理性和真實性。

無論采取哪種方式，都建議雙方保留好相關的證明文件和申報材料，以備將來可能的審查和核查。另外，如果有其他特殊情況或疑問，建議咨詢專業會計師或稅務機構，以確保申報的準確性和合規性。