在簽訂私車公用協議時，車輛日常維修費、保養費、年檢費等是否由公司承擔，取決于協議的具體條款。通常，這些費用由車主自行負責，但公司可能會根據協議提供一定的補貼或報銷。 如果協議中明確約定公司承擔這些費用，則公司應按約定支付；若無明確約定，則費用通常由車主承擔。建議在簽訂協議前，雙方應明確各自的責任和費用分擔，以避免后續爭議。 因此，是否由公司承擔這些費用，需以協議內容為準。