您好，增值稅匯總申報時，小微企業判定以總公司為準，與分公司單獨提示無關。計算時，先匯總總分支機構的銷項稅額，即（總機構當期應稅銷售額 + 各分支機構當期應稅銷售額）* 適用稅率；再匯總進項稅額，也就是總機構當期進項稅額與各分支機構當期進項稅額之和。用匯總后的銷項稅額減去進項稅額，再考慮上期留抵稅額及當期進項稅額轉出額，得出當期應納增值稅總額。 2.算出應納增值稅總額后，按銷售額比例在總機構和各分支機構間分配應納稅額。某機構當期應納增值稅額 = 總分支機構當期應納增值稅總額 *（該機構當期應稅銷售額 / 總機構匯總的銷售額 *100% ） 。總機構負責計算、分配稅額，編制明細表給分支機構。分支機構按分配表申報納稅，總機構將分配稅額作為已繳稅額填列，并留存相關資料 。