12月的工資3000元,1月份發3000元，2月份報所屬期1月份的3000元，是吧？

是的，這個看1月發出工資是幾時就申報幾時。

比如我11月工資0,我12月計提工資3000,1月才發放，2月申報1月份個稅時是填3000還是填0

這個申報所屬期是1月，這個表示1月發出工資，你們1月發多少就申報多少就可以。

我理解的實際發放的次月申報個稅，這個月應該申報12月的，但是12月沒有發工資，所以應該填0

你看所屬期是幾時，是12月話12月沒發出工資那就0申報。