但是，增值稅申報表中當月的銷項稅額與上期留底稅額和賬面實際數有該筆差額

請具體描述一下業務。

銷售商品未入賬

用以前年度損益調整

上期商品發出未收到發票，本期（跨年）收到發票。 如果是我描述的這種情況， 上期 借：發出商品 貸：庫存商品 同時 借應收賬款 貸 應交稅費-應交增值稅（銷項稅額） 稅款申報在申報表未開票欄內申報稅款 本期：分錄略，開具發票，申報時因稅款上期已繳納，在未開票欄內填寫負數。

上期是開出增值稅專用發票，未做收入

上期開出專用發票未做相關銷售收入賬務，當月的申報表是從大廳申報的，不是從網上，數據是自己填的不是系統自己帶出來的當時就沒報這筆收入稅金，本期做出調整后申報系統只顯示本期開出的銷項稅額數

這種情況你的上期申報表填錯了，到稅務局做更正申報。但是可能會有滯納金。

18年九月的申報數據也可以更正嗎？

呵呵。我們這邊的金稅三期可以。建議咨詢你的稅局。