但是扣除的錢也要發放出去，扣除的錢算不算到總額里面

扣除的錢算到總額里面，然后發出去沖減扣款部分就可以了。比如這個人應發工資5000。扣除500，實際發放4500元，扣除的部分500在其他應付款里體現，然后發給其他人，沖減其他應付款。

給另一部分人發放扣除的錢一部分是個人承擔一部分是公家承擔，表怎么做怎么區分那？

表區分不出來，只能是做賬時來區分開來。