增值稅優(yōu)惠，暫行條例第十五條第（二）項(xiàng)規(guī)定，避孕藥品和用具免征增值稅。 　　《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于繼續(xù)免征國產(chǎn)抗艾滋病病毒藥品增值稅的通知》（財(cái)稅〔2011〕128號(hào)）規(guī)定，定點(diǎn)企業(yè)生產(chǎn)的指定抗艾滋病病毒藥品2015年12月31日前免征增值稅。如果不是定點(diǎn)生產(chǎn)企業(yè)，或抗艾滋病病毒藥品不在免稅藥物品種清單中，則不能享受此項(xiàng)免稅優(yōu)惠。 　　《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于部分貨物適用增值稅低稅率和簡易辦法征收增值稅政策的通知》（財(cái)稅〔2009〕9號(hào)）第二條規(guī)定，一般納稅人銷售自產(chǎn)的，用微生物、微生物代謝產(chǎn)物、動(dòng)物毒素、人或動(dòng)物的血液或組織制成的生物制品，可選擇按照簡易辦法依照6%征收率計(jì)繳增值稅。 　　《國家稅務(wù)總局關(guān)于藥品經(jīng)營企業(yè)銷售生物制品有關(guān)增值稅問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2012年第20號(hào)）規(guī)定，屬于增值稅一般納稅人的藥品經(jīng)營企業(yè)銷售生物制品，可以選擇簡易辦法按3%征收率計(jì)繳增值稅。前提是要取得《藥品經(jīng)營許可證》。 　　企業(yè)所得稅優(yōu)惠　 　《國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈企業(yè)研究開發(fā)費(fèi)用稅前扣除管理辦法（試行） 〉的通知》（國稅發(fā)〔2008〕116號(hào)）規(guī)定，從事《國家重點(diǎn)支持的高新技術(shù)領(lǐng)域》和《當(dāng)前優(yōu)先發(fā)展的高技術(shù)產(chǎn)業(yè)化重點(diǎn)領(lǐng)域指南》規(guī)定項(xiàng)目的研究開發(fā)活動(dòng)，研發(fā)費(fèi)用稅前加計(jì)50%扣除。而《國家重點(diǎn)支持的高新技術(shù)領(lǐng)域目錄》中，“生物與新醫(yī)藥技術(shù)”是其中一大門類；《當(dāng)前優(yōu)先發(fā)展的高技術(shù)產(chǎn)業(yè)化重點(diǎn)領(lǐng)域指南（2011年度）》中，第二大類“生物”中，也有很多與醫(yī)藥行業(yè)有關(guān)，如新型疫苗、重大疾病創(chuàng)新藥物及關(guān)鍵技術(shù)、生物技術(shù)藥物及關(guān)鍵技術(shù)、中藥制品等等。　　根據(jù)企業(yè)所得稅法及其實(shí)施條例規(guī)定，高新技術(shù)企業(yè)享受15%低稅率優(yōu)惠。《國家重點(diǎn)支持的高新技術(shù)領(lǐng)域目錄》專列“生物與新醫(yī)藥技術(shù)”一大門類，對醫(yī)藥行業(yè)十分有利。　　注意事項(xiàng)　　獲取資質(zhì)。比如要享受15%低稅率優(yōu)惠，就要按企業(yè)所得稅法實(shí)施條例和《科技部、財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法〉的通知》（國科發(fā)火〔2008〕172號(hào)）的要求，擁有核心自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)，并在產(chǎn)品范圍、研發(fā)費(fèi)用占銷售收入比例、高新技術(shù)產(chǎn)品收入占總收比例、科技人員占職工總數(shù)比例等方面達(dá)到條件，通過認(rèn)定，獲得“高新技術(shù)企業(yè)證書”。　　一般納稅人選擇簡易辦法計(jì)繳增值稅，則36個(gè)月內(nèi)不得變更計(jì)稅方法。 　　分別核算。通常藥廠生產(chǎn)的藥品種類較多，有的藥品享受優(yōu)惠，有藥品則不能享受優(yōu)惠。如果不分別核算，則一律不能享受優(yōu)惠。 　　及時(shí)報(bào)批備案。無論增值稅優(yōu)惠，還是所得稅優(yōu)惠，都必須報(bào)稅務(wù)機(jī)關(guān)審批或備案。未經(jīng)審批或備案，企業(yè)不能自動(dòng)享受優(yōu)惠。