總、分機構 實行按月或按季申報,就地預繳.總機構應將統一計算的企業當期應納企業所得稅額,按核定的分配比例,計算總機構和各分支機構當期應納稅額,由總機構和分支機構分別向所在地主管稅務機關辦理納稅申報.各分支機構不進行企業所得稅匯算清繳,統一由總機構按照相關規定進行.總機構根據匯總計算的企業年度全部應納稅額,按規定的分攤比例,計算總機構和各分支機構的應納企業所得稅額,扣除各自已預繳的稅款,分別由總機構和分支機構多退少補.

分公司的流轉稅，必須在當地的稅務機關核算繳納,這個是流轉稅的基本原則.也就是到地稅申報繳納.現在基本上所有的城市國稅地稅申報都是網上申報,未開通網上申報的公司,可以憑借稅務登記證(正本副本)營業執照,基本行開戶許可證. 根據《國家稅務總局關于印發的公告》(國家稅務總局公告2012年第57號)的規定,匯總納稅企業實行統一計算、分級管理、就地預繳、匯總清算、財政調庫的企業所得稅征收管理辦法. 以總公司和符合獨立核算條件的各級分公司為就地預交所得稅的成員企業; 匯總納稅的銀行保險企業,以分行(分公司)、支行及相當于支行一級的辦事處(分理處),為就地預交所得稅的成員企業; 匯總納稅企業的分支機構需要進行年度企業所得稅申報. 匯算清繳時,分支機構除報送企業所得稅年度納稅申報表(只填列部分項目)外,還應報送經總機構所在地主管稅務機關受理的匯總納稅企業分支機構所得稅分配表、分支機構的年度財務報表.