新制度下，非財政補助結余是指事業單位除財政補助收支以外的各非專項資金收入與各非專項資金支出相抵后的余額。“非財政補助結余分配”科目則用于核算事業單位本年度非財政補助結余分配的情況和結果。年末，將“事業結余”科目余額和“經營結余”科目貸方余額結轉至“非財政補助結余分配”科目后，要按照規定進行結余分配。 （1）有企業所得稅繳納義務的事業單位計算出應繳納的企業所得稅，借記“非財政補助結余分配”科目，貸記“應繳稅費”科目； （2）按照有關規定提取職工福利基金的，按提取的金額，借記“非財政補助結余分配”科目，貸記“專用基金”科目； （3）將“非財政補助結余分配”科目余額結轉至事業基金，借記或貸記“非財政補助結余分配”科目，貸記或借記“事業基金”科目。