民營醫院稱備案制，各項收費由各醫院自行制定，報行政管理部門備案。例如一項收費核準價100元，公立醫院多收一分錢就違法違規，而民營醫院收150元，只要與備案價格一致就合法合規。每家收費也可能是不同的。另公立醫院不交稅，醫保覆蓋，民營醫院要交稅且不進醫保。 民營醫院如申請醫保定點單位，資質應符合相應的醫保政策。除了必須經過醫保審核，在設備硬件上和人員配備上則需和公立醫院一樣達到一定標準，30%以上的非公立醫院可以使用醫保報銷，而這一比例仍在擴大。