是收到借款時開，還是支付利息時開？收到借款時需要確認應付利息，同時計入相關費用成本，還是支付利息時計入相關費用成本？

肯定是收到利息的時候開票。

應計入在建工程的利息費用，是在初始確認時計入在建工程還是實際支付利息時計入在建工程？

這個在初始確認的時候就可以進入。