同學你好，建議總公司做賬，收款時，借：銀行存款，貸：其他應付款-分公司，支付工資時，借：其他應付款-分公司，貸：銀行存款。分公司開票時，借：其他應收款-總公司，貸：主營業務收入，應交稅費，總公司代發工資時，借：工程施工等科目，貸：其他應收款-總公司。