如果分公司虧損，獨立核算自負盈虧是不是在企業所得稅匯算清繳的時候總公司就不可以彌補分公司的虧損呢

您好 可以，這是企業自己內部約定的，稅法上所得稅是法人納稅，，分公司不是法人單位，還是總公司匯總計算，后面分給分公司申報，稅務處理是一樣的！

意思就是說核算方式只是公司內部約定的一種核算方式，跟稅這些沒關系對嗎？

對，這樣理解是正確的呢