股權不變，其中一位股東多繳納了部分出資，不想入資本公積。可否通過委托協議，調賬到另一股東的實收資本？

這樣是不可以的，只能是股權變更。

老師，如果匯算清繳結束之前將該多出資部分退還原股東，由另一股東重新注資進公司。是否不會影響工商年報和稅務報表？

正常來說，資本公積是不退還的。借款這些可以退還。

沒有入賬資本公積，全額計入了實收資本。如果出具股東會決議，是否可以退還多繳納部分資金？

另外查看了公司章程，對股東多出的部分出資未作規定。

。投資款多出來的，當時說是借款，你就可以退回去。 。其他人再投資進來，這個人要不是股東需要先做股東變更。