首先，個體公商戶收款付款頻繁，金額較大的風險主要包括：一是資金流向不透明，容易涉及非法交易，導致政府對商戶的監管變得更嚴格；二是由于商戶資金流向不透明，容易匯集多種資源，違反貨幣政策，被貨幣監管機構處以罰款；三是因為商戶收款付款頻繁，容易支付和收款人出現誤差，造成一定的損失。 為防止商戶收款付款頻繁，金額較大的風險，有以下的措施：一是做好資金管理，建立收款付款雙重檢查制度，及時發現交易異常；二是建立完善的審計制度，定期對商戶的賬戶進行審計；三是督促商戶建立完善的安全措施，實時監控收款付款行為，及時發現異常行為。