企業所得稅稅前扣除憑證發票風險提示是由于企業難以獲取足夠的憑證發票來支持發生的支出而導致的，例如發票丟失、發票不可征收等情況。此外，企業可能會因為減少成本而偷漏稅，從而錯誤地以更低的價格來計算應繳稅款，或者通過使用假發票以及弄虛作假來抵扣稅款。 為了處理這一風險提示，企業需要加強內部控制體系，并確保所有發票都可以得到準確備案，并實行及時繳稅的工作程序，同時及時審核憑證發票的準確性；另外，企業還需要制定相應的處罰措施，對上述行為進行有效監管，確保稅前扣除的準確性。此外，企業應該充分利用電子發票的技術，減少發票的丟失和灰色地帶，以降低企業可能發生的抵扣風險。