在公司簽訂拆除舊電梯收購合同時，如果約定款項不支付對方，而是直接從安裝電梯合同中扣減費用，首先應確認安裝電梯合同是有效的，并確定其費用及拆除舊電梯的價格是合理的，拆除舊電梯的價格不應過低，這樣才能確保雙方的權益得到保障。其次，應盡量避免兩個合同之間的直接財務關聯，而是采用其他形式進行支付，例如在購買新電梯之前進行貨物實際交付，或者簽署授權書等方式進行支付。最后，應根據兩個合同的條款，發展出一個完整的實施計劃，確保雙方及時和正確地完成付款，以及順利完成整個工程。除此之外，公司還應充分考慮到外部法律法規的影響，確保公司及其他相關方的合法權益得到保障。