月底的時候不管有沒有收到應收賬款和支付應付賬款都必須要做結轉嗎？ 結轉的時候是：借：主營業主成本 ，貸：庫存商品嗎？

因為你這里確實是收到了商品。

所以說你正常的結轉成本處理沒問題的。