商貿公司在半路開始建賬時，首先應該核實上一賬期的期末庫存金額，并將其作為本賬期的期初庫存金額輸入到財務軟件中。然后，根據本賬期實際發生的商貿業務，按照正確的記賬憑證填制憑證，并錄入到財務軟件中，并在財務軟件中體現各種公司賬務報表，最后再由會計人員結賬，以確保賬務的準確性和完整性。