從農民合作社購進農產品，如果取得普通發票，進項稅可以計算抵扣。根據企業所得稅法實施條例，小規模納稅人可以抵扣稅收，所以農民合作社普免稅的發票也可以抵扣稅收。此外，還可以使用差錯抵扣和專項扣除，差錯抵扣指的是納稅人在申報納稅的報表中確實存在誤差的情況下，可以把差錯金額作為抵扣計入損益，但計算辦法受有關規定的限制，專項扣除主要是指稅收居民憑有效證明可以在扣除稅前獲得扣除。支出項目必須符合具體條件，確保支出項目符合所提供的政策，以便抵扣稅收。 拓展知識：如果想更高效的抵扣稅收，比如采購稅收專用發票等方式，以及使用發票管理系統可以更好地抵扣稅收，以減少重新收發票和稅收管理的負擔。