是的，分公司可以開具設計費發票。因為總公司擁有建設工程設計資質證書，而分公司經營范圍有建設工程設計，因此分公司依然可以進行建設工程設計，并且可以開具設計費發票。這是因為中國建筑工程規范禁止拆分、轉讓或轉讓建設工程設計資質的情況下，總公司的資質可以保護分公司的資質，而在分公司的經營范圍中包含了建設工程設計，因此分公司仍然可以擁有資質開具設計費發票。 但需要注意的是，即便分公司獲得了總公司的資質保護，但仍然有一些法律法規需要遵守，例如分公司需要提交有關證據證明其在有效期內有資質執行建設工程設計，否則分公司也無法開具設計費發票。此外，相關的稅務政策也需要引起重視，確保發票的正確性和完整性，以免被稅務機關查處。