由法院開具發票，法院拍賣的土地和廠房還銀行貸款，具體流程如下： 1、由法院受理銀行貸款催收訴訟案件； 2、一旦受理，法院將會在合法、公開的拍賣會上拍賣該土地或廠房； 3、若拍賣能夠實現清償，法院將開具有關拍賣收入清償的發票； 4、拍賣后，法院出具財產抵償結果通知書，將財產抵償結果及其他相關程序交付債權人； 5、債權人拿著發票，和通知書去銀行辦理還款手續，以及將抵償金額轉入銀行賬戶。 拓展知識：法院在拍賣土地廠房的過程中，對投標方要求拍賣保證金，若中標者拍賣后放棄拍賣權，則法院保留拍賣保證金，減少未能清償的債務額，保護債權人的利益。