是的，會計憑證檔案可以多年放在一個憑證盒里。憑證盒里存儲原始憑證（例如財務憑證，票據，合同等），以及相關附件等。會計憑證盒管理辦法有: （1）編號分類：會計憑證盒根據編號分類，也就是按照年份分類，從比較早的一年開始排列，盒子內固定一頁，一邊邊號，另一面寫清年份，以此類推。 （2）專門管理：管理會計憑證盒時，應專門設立會計憑證盒文件，即憑證盒內放入不同種類的憑證，定期歸檔，及時保存，以便后續文件檢索使用。 （3）時間管理：會計憑證盒文件存放時間應有一定的規定，比如每季度清點報廢會計憑證盒文件，每年將存放年限個一年的會計憑證盒文件存放到永久會計檔案室，以保證其安全性。 另外，企業還可以采取更先進的電子媒體存儲技術來替代傳統的會計憑證盒方式，采用電子憑證備案，實現更靈活，更安全，更方便的管理方式。比如企業可以采用電子存檔的方式，將文件存儲在云上，在隨時可以審核查看；相比較傳統的會計憑證盒，這種方式更有利于企業減少存檔費用，提高會計質量，降低存檔風險，提高存檔效率。