公司與農戶合作種植的賬務處理包括以下步驟： 1、首先，農戶應向公司支付農肥、種子、農藥的費用； 2、秋收期間，公司應為農戶提供技術服務，包括農藥、農肥的使用、植物防病防蟲、收獲等； 3、耕作期間，公司把提供的費用支付給農戶，秋收期間，根據收成情況，確定對農戶的報酬； 4、根據產品收獲量，統計和計算每戶所收獲產品數量及價格； 5、結算所有農戶的產品收獲，以及公司付給農戶的報酬； 6、根據實際結果，及時準確的錄入總賬及明細賬等賬務憑證，將費用和收益及時核算登記。 上述賬務處理步驟只是公司與農戶合作種植的一般流程，實際上，還應根據具體的合作形式調整賬務處理步驟，以確保賬務準確、一致，并易于監控。此外，應加強農戶及公司收繳稅款的管理，準確報告公司和農戶之間稅費繳納情況，有效稅收落實。另外，公司應做好繼續增加對農戶的技術支持，以提高產量。