是的，取得自來水公司開具的3%的增值稅專用發票，可以勾選抵扣。根據《中華人民共和國增值稅暫行條例》第三十四條，增值稅納稅人在使用專用發票時，可以向稅務機關申請按規定的抵扣稅率，抵扣應納稅金額。而根據國家有關規定，自來水公司對水費的增值稅稅率為3%，因此自來水公司發票上申明的稅率和應納金額可以勾選抵扣。 以上就是取得自來水公司開具的3%的增值稅專用發票，可以勾選抵扣的問題的詳細說明。增值稅是我國稅收體系中的重要組成部分，它是根據物價變動而變動的，抵扣稅率對消費者和購買者也是一種積極經濟激勵，進而促進經濟發展。因此，有效地控制增值稅抵扣率，可以增強企業納稅義務，縮小稅收空白，同時也可以減輕消費者的負擔。