老師你好， 根據《中華人民共和國個人所得稅法》第八條規定，職工所得按勞務報酬所得計算，由用人單位按照月度繳納個人所得稅。 因此，甲方直接撥付給農民工的工資，施工單位應按照相關規定向稅務機關申報繳納個人所得稅。 具體繳納流程如下： （1）用人單位應按照月度向稅務機關申報收入所得情況，并準備相關報表。 （2）用人單位應按照稅務機關規定的標準繳納個人所得稅。 （3）稅務機關對報表和繳納情況進行核實，確認繳納情況是否按照有關規定執行。 （4）用人單位按照有關規定提出申報資料，并在規定期限內交納個人所得稅。 拓展知識 稅務機關同時也會對納稅單位工資發放情況進行審核，以確保單位是否依照有關規定支付工資，避免不正當支付的情況發生。此外，稅務機關也會定期檢查單位是否按期繳納個人所得稅，進行查處和處罰。