當兩家公司被認定為同一法定主體時，可以進行開票操作。但是在開票之前，需要進行資質認證，確保雙方公司具備開票合法性，可以通過營業執照、稅務登記證、組織機構代碼證等資質文件對雙方公司進行認定，以確保雙方認定為同一主體，真正是同一家公司。另外，需要注意的是，被認定的雙方公司財務信息也要統一，包括開票地址、發票抬頭、稅務登記號、開戶銀行等，一旦存在差異，可能會面臨政府監督部門的處罰。 另外，如果兩個公司行政地址不同，可能會受到稅務部門的把關。因為稅務部門針對同一公司多地開票這種情況，會認為存在一些問題，為了防止虛開發票的情況發生，會對發票開具情況嚴格審查，所以雙方公司地址最好保持一致，以避免被稅務部門監管。 總之，雙方法人相同，可以相互開發票，但是需要提前做好相關準備工作，核實兩個公司資質文件真實性，保證財務信息一致，避免受到政府監管，并定期審計財務信息以及開票情況，以免耽誤企業發展。 拓展知識：此外，如果雙方公司是跨境的經營關系，那么開票的雙方公司需要簽訂《稅務委托代理書》，另外還需要向當地稅務局申請開票，以確保開票手續的合法性。