是的，報關單和進項發票可以開在一起申報退稅，這是一種合理的申報方式。具體來說，報關單和進項發票可以獨立申報：首先，報關單需要重新填寫，報關單上的發票號要等于進項發票號，其次，報關單需要將進項發票和報關單全部上傳，最后，通過報關單可以獲取進項發票號，以及對應發票稅率，最后這兩個發票可以統一申報。 另外，有些情況下，進項發票會因為各種原因，無法和報關單合并申報，這種時候，可以通過增值稅普報來申報，這種情況下，進項發票的納稅起始月份，狀態為暫停，待報關單申報完成，可以將進項發票啟動，以便統一申報。 總的來說，報關單和進項發票可以合并申報退稅，但也要靈活應對特殊情況，通過增值稅普報來申報。