員工市內交通費的賬目處理如下： 1. 員工在購買公交車票、地鐵票、出租車票等市內交通票據時，應當出示有效的辦公室發放的員工代表憑證，并在消費憑證上注明公司名稱、消費用途、員工姓名等明確的內容。 2. 員工在出差活動中，如果出租車費超過200元，則需要出示費用發票，并在發票上注明公司名稱、出差活動名稱、員工姓名等明確的內容。 3. 對于未出示有效的憑證或發票的市內交通費，上級主管必須在結賬時親自簽字作為認可。 4. 在審核市內交通費用時，應當核查員工是否出示有效發票，并分清哪些屬于企業應負擔的交通費，哪些屬于員工自己的私人費用。 5. 拓展知識：記賬憑證可能形式多樣，有系統出納轉賬支票、支付寶、微信等轉賬憑證，也可以有現金憑證、禮品券憑證以及支票等。對賬目的處理不僅要求準確，還要求賬目的完整性。