疫情最低工資應扣除五險一金后的金額，因為五險一金也是一部分薪酬，不能算在最低工資里面。五險一金是政府制定的一種社會保障體系，其費用由企業和員工雙方各自承擔一部分。根據企業個體的情況，健全企業內部的費用管理，調整五險一金繳費比例，以實現社會保障的最優分配。拓展知識：五險一金包括養老、醫療、生育、工傷及失業保險，其中工傷及失業保險由企業承擔，養老、醫療、生育保險由企業與個人各自承擔，常規比例為企業四分之三，個人一分之三。