應該由供應商與總公司a和分公司b展開協商，由總公司a或分公司b向供應商發出收據，告知已經支付貨款并且收到貨物，同時請求供應商將發票開具給總公司a 。如果供應商拒絕，可以考慮通過法院等司法途徑進行糾紛解決。 此外，為了避免這種情況的發生，在未來的交易中，可以預先約定，將發票都開具給總公司a，將其他信息（如收貨人等）分別開具給分公司b。這樣可以有效令總公司a和分公司b在發票開具問題上的合作有條不紊。此外，還可以考慮設立專員，負責監督發票管理等事項，這樣可以加強集團內部的溝通，不斷完善管理機制，以免發生類似的問題。