代發工資和跨行轉入的區別在于資金的流向方式不同，代發工資是指雇主將資金通過銀行賬戶直接支付給雇員，在這種情況下，雇主將資金存入雇員的銀行賬戶中，該賬戶的所有人是雇員本人。跨行轉入是指雇主將資金通過銀行賬戶支付給另一家銀行，另一家銀行再將該筆資金轉入雇員的銀行賬戶中。因此，您的工資是由甲公司發放的，但是你的工資卡是中信銀行的，所以，雇主將資金通過交通銀行上海分行的轉入接口轉入您的中信銀行銀行卡中。 拓展知識：現在，許多企業都采取代發工資的形式，其主要優點是快捷、方便，可以更快地將資金轉給雇員；而跨行轉入雖然稍有復雜，但是資金到賬安全可靠，有利于保護雇員和雇主的權益。